醫院始建于1905年美國長老會創辦的“仁濟醫院”。民國初期至1996年前為縣級醫院，1997年升格為地市級醫院。2003年7月10日由政府主導，本著“靠大、靠外、靠強”的原則，加盟南京鼓樓醫院集團，由金陵藥業聯合南京鼓樓醫院出資7012萬元收購宿遷市人民醫院70%產權，宿遷市政府保留30%產權，醫院更名為“南京鼓樓醫院集團宿遷市人民醫院”，是全國第一家地市級公立醫院改制醫院。醫院2005年9月晉升為三級綜合醫院，2008年12月被評為三級乙等醫院。2019年2月通過三級甲等綜合醫院評審。2021年7月12日，更名為“南京鼓樓醫院集團宿遷醫院”。

醫院占地面積63240平方米，現有醫療用房建筑面積17.2萬平方米。引進3.0核磁共振、256排螺旋CT、DSA等大型醫療設備，可為患者提供全面、便捷、精準的醫療服務。2013年，投資1.84億元建成4.5萬平方米外科樓，2020年，投入2.81億元建成6.9萬門急診病房綜合樓，改善了患者的就醫條件。改制至今，累計在基建和設備方面的投入超過14億元。

醫院開放床位2000張，現有48個臨床病區，17個醫技科室，其中江蘇省臨床重點?？萍敖ㄔO單位3個，宿遷市臨床重點?？萍敖ㄔO單位29個，宿遷市醫學重點學科及建設單位13個，醫院先后創建成為國家胸痛中心、國家腦防委高級卒中中心及中國創傷聯盟創傷中心建設單位，江蘇省危急重癥孕產婦救治中心、江蘇省區域胸痛、卒中、創傷救治中心，宿遷市胸痛、創傷、卒中、孕產婦及新生兒危急重癥救治中心，宿遷市綜合救援基地、宿遷市中毒救援基地。2020年12月，獲批國家第三批住院醫師規范化培訓基地。

醫院現有職工2026人、衛技人員1797人，全院高級職稱371人、中級職稱655人，碩士285，博士8人（在讀17人），江蘇省有突出貢獻專家3人、江蘇省333工程培養對象33人、市千名拔尖人才56人、蘇北特聘專家4人。

2019年至今，我院獲批江蘇省科技廳項目1項，江蘇省衛健委科研項目10項，江蘇省中醫藥管理局項目2項，江蘇省醫院協會科研項目4項，江蘇省婦幼保健協會科研項目2項，江蘇省藥學會科研項目7項，江蘇省科協“青年科技人才托舉工程”3項，宿遷市指令性項目33項，宿遷市指導性項目81項，徐州醫科大學科技項目15項。榮獲江蘇省婦幼保健協會新技術引進獎三等獎1項，榮獲中國醫藥教育協會科技獎三等獎2項，榮獲淮?？茖W技術獎二等獎1項，三等獎2項。

醫院不斷加大軟硬件的投入，加快發展步伐，強化科學管理，通過“互聯網+”改善醫療服務，不斷提高醫療質量和技術水平，強化醫德醫風建設，醫教研等方面取得了長足性進步，同時注重對外進行醫學技術和醫院管理的交流，與美國、德國、加拿大、日本等國家的醫療機構建立了互派專家、學者訪問、考察和進修等學術交流機制。醫院先后榮獲“全國百姓放心示范醫院”、“全國模范職工之家”、“江蘇省先進基層黨組織”、“江蘇省衛生系統先進單位”、“江蘇省醫保管理AAA級誠信服務單位”、“江蘇省衛生行風先進單位”、“全國百姓放心醫院百佳示范醫院”、“江蘇省平安示范醫院”、“江蘇省母嬰安全優質服務單位”、“江蘇省母嬰友好醫院”等榮譽稱號。